Геном прокариот/Материалы:NC 006138

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_006138            3523383 bp    DNA     circular BCT 29-JUN-2007
   DEFINITION  Desulfotalea psychrophila LSv54, complete genome.
   ACCESSION   NC_006138
   VERSION     NC_006138.1  GI:51243852
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Desulfotalea psychrophila LSv54
     ORGANISM  Desulfotalea psychrophila LSv54
               Bacteria; Proteobacteria; Deltaproteobacteria; Desulfobacterales;
               Desulfobulbaceae; Desulfotalea.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3523383)
     AUTHORS   Rabus,R., Ruepp,A., Frickey,T., Rattei,T., Fartmann,B., Stark,M.,
               Bauer,M., Zibat,A., Lombardot,T., Becker,I., Amann,J., Gellner,H.,
               Teeling,H., Leuschner,W.D., Gloeckner,F.-O., Lupas,A.N., Amann,R.
               and Klenk,H.-P.
     TITLE     The genome of Desulfotalea psychrophila, a sulfate-reducing
               bacterium from permanently cold Arctic sediments
     JOURNAL   Environ. Microbiol. 6 (9), 887-902 (2004)
      PUBMED   15305914
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3523383)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (16-AUG-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3523383)
     AUTHORS   Klenk,H.-P.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (11-JUN-2004) e.gene Biotechnologie GmbH, Poeckinger
               Fussweg 7a, Feldafing 82340, Germany
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CR522870.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
109126	109207	-	82	51243852	DPt01	-	^{15 Leu tRNA}
109450	109531	-	82	51243852	DPt02	-	^{15 Leu tRNA}
204878	204951	-	74	51243852	DPt03	-	^{16 Met tRNA}
363838	363931	+	94	51243852	DPt04	-	Sec tRNA
455456	455539	-	84	51243852	DPt05	-	^{15 Leu tRNA}
569247	569612	-	366	51243852	DPs01	-	tmRNA
671882	671953	-	72	51243852	DPt06	-	^{01 Gly tRNA}
694725	694798	-	74	51243852	DPt07	-	^{16 Met tRNA}
721238	721312	-	75	51243852	DPt08	-	^{03 Pro tRNA}
721353	721425	-	73	51243852	DPt09	-	^{07 Asn tRNA}
763119	763193	-	75	51243852	DPt10	-	^{04 Glu tRNA}
763204	763276	-	73	51243852	DPt11	-	^{10 Lys tRNA}
766549	766623	-	75	51243852	DPt12	-	^{04 Glu tRNA}
766643	766715	-	73	51243852	DPt13	-	^{10 Lys tRNA}
785820	785902	+	83	51243852	DPt14	-	^{08 Ser tRNA}
785914	786002	+	89	51243852	DPt15	-	^{08 Ser tRNA}
806221	807760	+	1540	51243852	DPr01	-	16S ribosomal RNA
807932	808005	+	74	51243852	DPt16	-	^{14 Ile tRNA}
808013	808085	+	73	51243852	DPt17	-	^{02 Ala tRNA}
808358	811273	+	2916	51243852	DPr02	-	23S ribosomal RNA
811329	811457	+	129	51243852	DPr03	-	5S ribosomal RNA
814573	816111	+	1539	51243852	DPr04	-	16S ribosomal RNA
816463	819378	+	2916	51243852	DPr05	-	23S ribosomal RNA
819434	819562	+	129	51243852	DPr06	-	5S ribosomal RNA
822143	823681	+	1539	51243852	DPr07	-	16S ribosomal RNA
824033	826950	+	2918	51243852	DPr08	-	23S ribosomal RNA
827006	827134	+	129	51243852	DPr09	-	5S ribosomal RNA
1046822	1046895	+	74	51243852	DPt18	-	^{11 Arg tRNA}
1098886	1100425	+	1540	51243852	DPr10	-	16S ribosomal RNA
1100777	1103693	+	2917	51243852	DPr11	-	23S ribosomal RNA
1103749	1103877	+	129	51243852	DPr12	-	5S ribosomal RNA
1171946	1172019	-	74	51243852	DPt19	-	^{11 Arg tRNA}
1217738	1217810	-	73	51243852	DPt20	-	^{02 Ala tRNA}
1236403	1236486	-	84	51243852	DPt21	-	^{15 Leu tRNA}
1253754	1253826	+	73	51243852	DPt22	-	^{12 Thr tRNA}
1253905	1253986	+	82	51243852	DPt23	-	^{18 Tyr tRNA}
1254008	1254080	+	73	51243852	DPt24	-	^{01 Gly tRNA}
1254103	1254175	+	73	51243852	DPt25	-	^{12 Thr tRNA}
1255659	1255732	+	74	51243852	DPt26	-	^{20 Trp tRNA}
1305274	1305347	+	74	51243852	DPt27	-	^{11 Arg tRNA}
1389530	1389601	-	72	51243852	DPt28	-	^{19 Cys tRNA}
1446518	1446646	-	129	51243852	DPr13	-	5S ribosomal RNA
1458622	1458750	-	129	51243852	DPr14	-	5S ribosomal RNA
1458806	1461724	-	2919	51243852	DPr15	-	23S ribosomal RNA
1462002	1462074	-	73	51243852	DPt29	-	^{02 Ala tRNA}
1462082	1462155	-	74	51243852	DPt30	-	^{14 Ile tRNA}
1462305	1463843	-	1539	51243852	DPr16	-	16S ribosomal RNA
1482940	1483011	-	72	51243852	DPt31	-	^{01 Gly tRNA}
1586568	1586642	-	75	51243852	DPt32	-	^{03 Pro tRNA}
1594869	1594940	-	72	51243852	DPt33	-	^{13 Val tRNA}
1606559	1606641	+	83	51243852	DPt34	-	^{08 Ser tRNA}
1787898	1787981	-	84	51243852	DPt35	-	^{15 Leu tRNA}
1791403	1791484	+	82	51243852	DPt36	-	^{15 Leu tRNA}
1925351	1926890	+	1540	51243852	DPr17	-	16S ribosomal RNA
1927267	1930182	+	2916	51243852	DPr18	-	23S ribosomal RNA
1930238	1930366	+	129	51243852	DPr19	-	5S ribosomal RNA
1946848	1946921	-	74	51243852	DPt37	-	^{16 Met tRNA}
1946950	1947023	-	74	51243852	DPt38	-	^{16 Met tRNA}
2009493	2009565	-	73	51243852	DPt39	-	^{17 Phe tRNA}
2024798	2024870	-	73	51243852	DPt40	-	^{17 Phe tRNA}
2106125	2106198	+	74	51243852	DPt41	-	^{16 Met tRNA}
2154677	2156215	+	1539	51243852	DPr20	-	16S ribosomal RNA
2156592	2159507	+	2916	51243852	DPr21	-	23S ribosomal RNA
2159563	2159691	+	129	51243852	DPr22	-	5S ribosomal RNA
2262519	2262591	+	73	51243852	DPt42	-	^{12 Thr tRNA}
2426699	2426772	+	74	51243852	DPt43	-	^{09 His tRNA}
2607760	2607833	-	74	51243852	DPt44	-	^{09 His tRNA}
2853781	2853852	+	72	51243852	DPt45	-	^{04 Glu tRNA}
2874487	2874558	+	72	51243852	DPt46	-	^{04 Glu tRNA}
2888211	2888284	-	74	51243852	DPt47	-	^{06 Asp tRNA}
2888343	2888415	-	73	51243852	DPt48	-	^{13 Val tRNA}
2888439	2888512	-	74	51243852	DPt49	-	^{06 Asp tRNA}
2888571	2888643	-	73	51243852	DPt50	-	^{13 Val tRNA}
2888666	2888739	-	74	51243852	DPt51	-	^{06 Asp tRNA}
2888798	2888870	-	73	51243852	DPt52	-	^{13 Val tRNA}
2888892	2888965	-	74	51243852	DPt53	-	^{06 Asp tRNA}
2889024	2889096	-	73	51243852	DPt54	-	^{13 Val tRNA}
2889119	2889192	-	74	51243852	DPt55	-	^{06 Asp tRNA}
2889251	2889323	-	73	51243852	DPt56	-	^{13 Val tRNA}
2889345	2889418	-	74	51243852	DPt57	-	^{06 Asp tRNA}
2889481	2889553	-	73	51243852	DPt58	-	^{13 Val tRNA}
3096346	3096417	-	72	51243852	DPt59	-	^{05 Gln tRNA}
3096606	3096677	-	72	51243852	DPt60	-	^{05 Gln tRNA}
3358387	3358468	+	82	51243852	DPt61	-	^{18 Tyr tRNA}
3358583	3358655	+	73	51243852	DPt62	-	^{12 Thr tRNA}
3396270	3396343	-	74	51243852	DPt63	-	^{11 Arg tRNA}
3403887	3403960	-	74	51243852	DPt64	-	^{11 Arg tRNA}