Геном прокариот/Материалы:NC 008358

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_008358            3705021 bp    DNA     circular BCT 19-SEP-2006
   DEFINITION  Hyphomonas neptunium ATCC 15444, complete genome.
   ACCESSION   NC_008358
   VERSION     NC_008358.1  GI:114797051
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Hyphomonas neptunium ATCC 15444
     ORGANISM  Hyphomonas neptunium ATCC 15444
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales;
               Hyphomonadaceae; Hyphomonas.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3705021)
     AUTHORS   Badger,J.H., Hoover,T.R., Brun,Y.V., Weiner,R.M., Laub,M.T.,
               Alexandre,G., Mrazek,J., Ren,Q., Paulsen,I.T., Nelson,K.E.,
               Khouri,H.M., Radune,D., Sosa,J., Dodson,R.J., Sullivan,S.A.,
               Rosovitz,M.J., Madupu,R., Brinkac,L.M., Durkin,A.S.,
               Daugherty,S.C., Kothari,S.P., Giglio,M.G., Zhou,L., Haft,D.H.,
               Selengut,J.D., Davidsen,T.M., Yang,Q., Zafar,N. and Ward,N.L.
     TITLE     Comparative Genomic Evidence for a Close Relationship between the
               Dimorphic Prosthecate Bacteria Hyphomonas neptunium and Caulobacter
               crescentus
     JOURNAL   J. Bacteriol. 188 (19), 6841-6850 (2006)
      PUBMED   16980487
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3705021)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (19-SEP-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3705021)
     AUTHORS   Badger,J.H., Hoover,T.R., Brun,Y.V., Weiner,R.M., Laub,M.T.,
               Alexandre,G., Mrazek,J., Ren,Q., Paulsen,I.T., Nelson,K.E.,
               Khouri,H.M., Radune,D., Sosa,J., Dodson,R.J., Sullivan,S.A.,
               Rosovitz,M.J., Madupu,R., Brinkac,L.M., Durkin,A.S.,
               Daugherty,S.C., Kothari,S.P., Giglio,M.G., Zhou,L., Haft,D.H.,
               Selengut,J., Davidsen,T.M., Yang,Q., Zafar,N. and Ward,N.L.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-JUL-2006) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000158.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
183585	183660	+	76	114797051	HNE_0197	-	^{02 Ala tRNA}
217164	217240	-	77	114797051	HNE_0224	-	^{11 Arg tRNA}
223246	223320	+	75	114797051	HNE_0232	-	^{13 Val tRNA}
542000	542076	-	77	114797051	HNE_0545	-	^{16 Met tRNA}
714902	714976	-	75	114797051	HNE_0703	-	^{13 Val tRNA}
977472	977557	-	86	114797051	HNE_0963	-	^{15 Leu tRNA}
993699	993774	+	76	114797051	HNE_0978	-	^{13 Val tRNA}
1013000	1013073	-	74	114797051	HNE_1000	-	^{01 Gly tRNA}
1032600	1032676	-	77	114797051	HNE_1022	-	^{16 Met tRNA}
1072135	1072219	+	85	114797051	HNE_1063	-	^{15 Leu tRNA}
1143571	1143646	+	76	114797051	HNE_1132	-	^{10 Lys tRNA}
1176429	1176506	-	78	114797051	HNE_1165	-	^{03 Pro tRNA}
1376876	1376950	-	75	114797051	HNE_1341	-	^{12 Thr tRNA}
1458130	1458206	+	77	114797051	HNE_1425	-	^{06 Asp tRNA}
1627993	1628077	+	85	114797051	HNE_1595	-	^{15 Leu tRNA}
1726191	1726264	+	74	114797051	HNE_1680	-	^{19 Cys tRNA}
1726607	1726682	+	76	114797051	HNE_1682	-	^{07 Asn tRNA}
1773314	1773388	-	75	114797051	HNE_1730	-	^{17 Phe tRNA}
1778392	1778467	+	76	114797051	HNE_1736	-	^{20 Trp tRNA}
1862948	1863037	+	90	114797051	HNE_1816	-	^{08 Ser tRNA}
1887504	1887579	-	76	114797051	HNE_1829	-	^{12 Thr tRNA}
2036053	2036127	-	75	114797051	HNE_1967	-	^{04 Glu tRNA}
2075939	2076015	-	77	114797051	HNE_1999	-	^{09 His tRNA}
2152440	2152524	+	85	114797051	HNE_2078	-	^{15 Leu tRNA}
2341931	2342020	-	90	114797051	HNE_2238	-	^{08 Ser tRNA}
2615670	2615764	-	95	114797051	HNE_2487	-	Sec tRNA
2711836	2711925	-	90	114797051	HNE_2557	-	^{08 Ser tRNA}
2727619	2727695	+	77	114797051	HNE_2573	-	^{03 Pro tRNA}
2728063	2728139	+	77	114797051	HNE_2575	-	^{11 Arg tRNA}
2762395	2762469	-	75	114797051	HNE_2599	-	^{01 Gly tRNA}
2796971	2797044	-	74	114797051	HNE_2637	-	^{05 Gln tRNA}
2814506	2814582	-	77	114797051	HNE_2654	-	^{16 Met tRNA}
2814765	2814883	-	119	114797051	HNE_2655	-	5S ribosomal RNA
2814978	2817750	-	2773	114797051	HNE_2656	-	23S ribosomal RNA
2818014	2818089	-	76	114797051	HNE_2657	-	^{02 Ala tRNA}
2818161	2818237	-	77	114797051	HNE_2658	-	^{14 Ile tRNA}
2818559	2819913	-	1355	114797051	HNE_2659	-	16S ribosomal RNA
2844612	2844685	-	74	114797051	HNE_2683	-	^{01 Gly tRNA}
2846059	2846143	-	85	114797051	HNE_2685	-	^{18 Tyr tRNA}
2899602	2899678	+	77	114797051	HNE_2738	-	^{03 Pro tRNA}
3121003	3121313	-	311	114797051	HNE_2964	-	sRNA
3217479	3217550	+	72	114797051	HNE_3046	-	^{17 Phe tRNA}
3325490	3325566	-	77	114797051	HNE_3145	-	^{11 Arg tRNA}
3391163	3391246	-	84	114797051	HNE_3222	-	^{15 Leu tRNA}
3400123	3400198	+	76	114797051	HNE_3231	-	^{12 Thr tRNA}
3585191	3585267	-	77	114797051	HNE_3447	-	^{11 Arg tRNA}
3613097	3613184	-	88	114797051	HNE_3478	-	^{08 Ser tRNA}