Материалы:NC 008313

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_008313            4052032 bp    DNA     circular BCT 27-JUN-2007
   DEFINITION  Ralstonia eutropha H16 chromosome 1, complete sequence.
   ACCESSION   NC_008313
   VERSION     NC_008313.1  GI:113866031
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Ralstonia eutropha H16
     ORGANISM  Ralstonia eutropha H16
               Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales;
               Burkholderiaceae; Cupriavidus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4052032)
     AUTHORS   Pohlmann,A., Fricke,W.F., Reinecke,F., Kusian,B., Liesegang,H.,
               Cramm,R., Eitinger,T., Ewering,C., Potter,M., Schwartz,E.,
               Strittmatter,A., Voss,I., Gottschalk,G., Steinbuchel,A.,
               Friedrich,B. and Bowien,B.
     TITLE     Genome sequence of the bioplastic-producing 'Knallgas' bacterium
               Ralstonia eutropha H16
     JOURNAL   Nat. Biotechnol. 24 (10), 1257-1262 (2006)
      PUBMED   16964242
     REMARK    Erratum:[Nat Biotechnol. 2007 Apr;25(4):478]
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4052032)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (01-SEP-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4052032)
     AUTHORS   Fricke,W.F.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-APR-2006) Fricke W.F., Institute for Microbiology and
               Genetics, Goettingen Genomics Laboratory, Grisebachstr. 8,
               Goettingen 37077, GERMANY
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AM260479.
               URL -- http://www.g2l.bio.uni-goettingen.de
               Contacts: Heiko Liesegang (hlieseg@gwdg.de).
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
279140	279212	+	73	113866031	H16_A0268	-	^{19 Cys tRNA}
391392	391468	-	77	113866031	H16_A0373	-	^{05 Gln tRNA}
566469	566545	-	77	113866031	H16_A0539	-	^{16 Met tRNA}
831628	831715	+	88	113866031	H16_A0765	-	^{08 Ser tRNA}
1040614	1040703	-	90	113866031	H16_A0945	-	^{08 Ser tRNA}
1051815	1051889	+	75	113866031	H16_A0957	-	^{11 Arg tRNA}
1090717	1090792	-	76	113866031	H16_A0998	-	^{12 Thr tRNA}
1147185	1147267	+	83	113866031	H16_A1049	-	^{15 Leu tRNA}
1331515	1331606	+	92	113866031	H16_A1226	-	^{08 Ser tRNA}
1452484	1452558	+	75	113866031	H16_A1338	-	^{13 Val tRNA}
1461034	1461108	+	75	113866031	H16_A1347	-	^{03 Pro tRNA}
1474911	1474986	-	76	113866031	H16_A1361	-	^{10 Lys tRNA}
1477680	1477755	-	76	113866031	H16_A1364	-	^{10 Lys tRNA}
1522216	1522291	-	76	113866031	H16_A1405	-	^{16 Met tRNA}
1603751	1603837	-	87	113866031	H16_A1478	-	^{15 Leu tRNA}
1614153	1614226	+	74	113866031	H16_A1486	-	^{13 Val tRNA}
1625700	1625774	+	75	113866031	H16_A1498	-	^{06 Asp tRNA}
1806458	1807992	+	1535	113866031	H16_A1659	-	16S ribosomal RNA
1808320	1811335	+	3016	113866031	H16_A1660	-	23S ribosomal RNA
1811521	1811635	+	115	113866031	H16_A1661	-	5S ribosomal RNA
2259217	2259291	+	75	113866031	H16_A2077	-	^{13 Val tRNA}
2310579	2310663	+	85	113866031	H16_A2126	-	^{15 Leu tRNA}
2311381	2311465	+	85	113866031	H16_A2127	-	^{15 Leu tRNA}
2478126	2478201	-	76	113866031	H16_A2286	-	^{09 His tRNA}
2554014	2554098	+	85	113866031	H16_A2350	-	^{15 Leu tRNA}
2614094	2614170	-	77	113866031	H16_A2400	-	^{06 Asp tRNA}
2614234	2614309	-	76	113866031	H16_A2401	-	^{04 Glu tRNA}
2614376	2614451	-	76	113866031	H16_A2402	-	^{02 Ala tRNA}
2643616	2643692	-	77	113866031	H16_A2427	-	^{11 Arg tRNA}
2645411	2645485	+	75	113866031	H16_A2429	-	^{03 Pro tRNA}
2688539	2688611	+	73	113866031	H16_A2468	-	^{13 Val tRNA}
2733383	2733473	-	91	113866031	H16_A2523	-	^{08 Ser tRNA}
2749388	2749472	+	85	113866031	H16_A2539	-	^{15 Leu tRNA}
2753348	2753421	-	74	113866031	H16_A2543	-	^{19 Cys tRNA}
2753542	2753617	-	76	113866031	H16_A2544	-	^{01 Gly tRNA}
2753678	2753753	-	76	113866031	H16_A2545	-	^{01 Gly tRNA}
2800347	2800420	+	74	113866031	H16_A2593	-	^{07 Asn tRNA}
2891390	2891464	-	75	113866031	H16_A2679	-	^{11 Arg tRNA}
3052475	3052550	-	76	113866031	H16_A2824	-	^{10 Lys tRNA}
3095406	3095478	+	73	113866031	H16_A2869	-	^{01 Gly tRNA}
3252685	3252767	+	83	113866031	H16_A3006	-	^{15 Leu tRNA}
3514987	3515061	+	75	113866031	H16_A3254	-	^{03 Pro tRNA}
3575211	3575327	-	117	113866031	H16_A3302	-	5S ribosomal RNA
3575502	3578320	-	2819	113866031	H16_A3303	-	23S ribosomal RNA
3578617	3578692	-	76	113866031	H16_A3304	-	^{02 Ala tRNA}
3578705	3578781	-	77	113866031	H16_A3305	-	^{14 Ile tRNA}
3578844	3580380	-	1537	113866031	H16_A3306	-	16S ribosomal RNA
3674199	3674274	-	76	113866031	H16_A3393	-	^{12 Thr tRNA}
3778541	3778616	-	76	113866031	H16_A3504	-	^{20 Trp tRNA}
3779937	3780011	-	75	113866031	H16_A3506	-	^{12 Thr tRNA}
3780049	3780122	-	74	113866031	H16_A3507	-	^{01 Gly tRNA}
3780174	3780259	-	86	113866031	H16_A3508	-	^{18 Tyr tRNA}
3780548	3780664	-	117	113866031	H16_A3509	-	5S ribosomal RNA
3780839	3783657	-	2819	113866031	H16_A3510	-	23S ribosomal RNA
3783954	3784029	-	76	113866031	H16_A3511	-	^{02 Ala tRNA}
3784042	3784118	-	77	113866031	H16_A3512	-	^{14 Ile tRNA}
3784181	3785717	-	1537	113866031	H16_A3513	-	16S ribosomal RNA
3834937	3835012	-	76	113866031	H16_A3562	-	^{02 Ala tRNA}
3882930	3883005	-	76	113866031	H16_A3613	-	^{11 Arg tRNA}
3983051	3983126	-	76	113866031	H16_A3693	-	^{17 Phe tRNA}