Материалы:NC 009800

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_009800            4643538 bp    DNA     circular BCT 14-SEP-2007
   DEFINITION  Escherichia coli HS, complete genome.
   ACCESSION   NC_009800
   VERSION     NC_009800.1  GI:157159467
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Escherichia coli HS
     ORGANISM  Escherichia coli HS
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
               Enterobacteriaceae; Escherichia.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4643538)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (13-SEP-2007) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4643538)
     AUTHORS   Rasko,D.A., Rosovitz,M., Kaper,J.B., Nataro,J.P., Myers,G.S.,
               Seshadri,R., Cer,R.Z. and Ravel,J.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (13-AUG-2007) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000802.
               Source DNA and bacteria available from Jacques Ravel
               (jravel@tigr.org).
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
187870	188005	+	136	157159467	EcHS_A4731	-	t44 RNA
223160	224701	+	1542	157159467	EcHS_A4732	-	16S ribosomal RNA
224770	224846	+	77	157159467	EcHS_A4641	-	^{14 Ile tRNA}
224888	224965	+	78	157159467	EcHS_A4642	-	^{02 Ala tRNA}
225139	228041	+	2903	157159467	EcHS_A4733	-	23S ribosomal RNA
228136	228251	+	116	157159467	EcHS_A4734	-	5S ribosomal RNA
228305	228383	+	79	157159467	EcHS_A4643	-	^{06 Asp tRNA}
236529	236607	+	79	157159467	EcHS_A4644	-	^{06 Asp tRNA}
291741	291816	+	76	157159467	EcHS_A4645	-	^{12 Thr tRNA}
411322	411402	+	81	157159467	EcHS_A4646	-	Xaa tRNA
542520	542619	+	100	157159467	EcHS_A4735	-	bacterial signal recognition particle RNA
573269	573352	+	84	157159467	EcHS_A4736	-	sroB RNA
624260	624338	+	79	157159467	EcHS_A4647	-	^{11 Arg tRNA}
714829	714991	-	163	157159467	EcHS_A4737	-	sroC RNA
725439	725515	-	77	157159467	EcHS_A4648	-	^{05 Gln tRNA}
725551	725627	-	77	157159467	EcHS_A4649	-	^{05 Gln tRNA}
725673	725751	-	79	157159467	EcHS_A4650	-	^{16 Met tRNA}
725765	725841	-	77	157159467	EcHS_A4651	-	^{05 Gln tRNA}
725875	725949	-	75	157159467	EcHS_A4652	-	^{05 Gln tRNA}
725972	726058	-	87	157159467	EcHS_A4653	-	^{15 Leu tRNA}
726065	726143	-	79	157159467	EcHS_A4654	-	^{16 Met tRNA}
807407	807484	+	78	157159467	EcHS_A4655	-	^{10 Lys tRNA}
807618	807695	+	78	157159467	EcHS_A4656	-	^{13 Val tRNA}
807697	807772	+	76	157159467	EcHS_A4657	-	^{10 Lys tRNA}
807824	807899	+	76	157159467	EcHS_A4658	-	^{13 Val tRNA}
807903	807978	+	76	157159467	EcHS_A4659	-	^{10 Lys tRNA}
808124	808201	+	78	157159467	EcHS_A4660	-	^{10 Lys tRNA}
808333	808408	+	76	157159467	EcHS_A4661	-	^{10 Lys tRNA}
948276	948354	-	79	157159467	EcHS_A4738	-	rybB RNA
986231	986320	-	90	157159467	EcHS_A4662	-	^{08 Ser tRNA}
1093238	1093327	-	90	157159467	EcHS_A4663	-	^{08 Ser tRNA}
1160460	1160549	-	90	157159467	EcHS_A4664	-	^{08 Ser tRNA}
1210269	1210437	+	169	157159467	EcHS_A4740	-	sraB RNA
1279068	1279146	+	79	157159467	EcHS_A4741	-	C0299 RNA
1335326	1335412	-	87	157159467	EcHS_A4665	-	^{18 Tyr tRNA}
1335795	1335881	-	87	157159467	EcHS_A4666	-	^{18 Tyr tRNA}
1451882	1452061	+	180	157159467	EcHS_A4742	-	IS061 RNA
1455615	1455689	+	75	157159467	EcHS_A4743	-	C0343 RNA
1460310	1460432	+	123	157159467	EcHS_A4744	-	IS063 RNA
1768458	1768536	+	79	157159467	EcHS_A4667	-	^{13 Val tRNA}
1768539	1768617	+	79	157159467	EcHS_A4668	-	^{13 Val tRNA}
1786737	1786804	+	68	157159467	EcHS_A4745	-	rydB RNA
1792396	1792503	+	108	157159467	EcHS_A4746	-	rprA RNA
1906219	1906304	-	86	157159467	EcHS_A4747	-	sroD RNA
1942043	1942291	+	249	157159467	EcHS_A4748	-	sraC/ryeA RNA
1942081	1942180	-	100	157159467	EcHS_A4749	-	RyeB RNA
1991910	1991987	+	78	157159467	EcHS_A4750	-	C0465 RNA
2011442	2011528	-	87	157159467	EcHS_A4669	-	^{15 Leu tRNA}
2011541	2011614	-	74	157159467	EcHS_A4670	-	^{19 Cys tRNA}
2011669	2011744	-	76	157159467	EcHS_A4671	-	^{01 Gly tRNA}
2044967	2045053	-	87	157159467	EcHS_A4751	-	DsrA RNA
2082069	2082160	-	92	157159467	EcHS_A4672	-	^{08 Ser tRNA}
2083150	2083227	+	78	157159467	EcHS_A4673	-	^{07 Asn tRNA}
2096629	2096706	-	78	157159467	EcHS_A4674	-	^{07 Asn tRNA}
2098453	2098530	+	78	157159467	EcHS_A4675	-	^{07 Asn tRNA}
2100861	2100938	+	78	157159467	EcHS_A4676	-	^{07 Asn tRNA}
2197516	2197664	+	149	157159467	EcHS_A4752	-	QUAD RNA
2197851	2197993	+	143	157159467	EcHS_A4753	-	QUAD RNA
2211353	2211438	+	86	157159467	EcHS_A4754	-	RyeE RNA
2328388	2328466	+	79	157159467	EcHS_A4677	-	^{03 Pro tRNA}
2354067	2354160	+	94	157159467	EcHS_A4756	-	micF RNA
2507928	2508004	+	77	157159467	EcHS_A4678	-	^{11 Arg tRNA}
2549442	2549519	-	78	157159467	EcHS_A4679	-	^{02 Ala tRNA}
2549558	2549633	-	76	157159467	EcHS_A4680	-	^{02 Ala tRNA}
2552333	2552408	+	76	157159467	EcHS_A4681	-	^{13 Val tRNA}
2552452	2552529	+	78	157159467	EcHS_A4682	-	^{13 Val tRNA}
2552574	2552651	+	78	157159467	EcHS_A4683	-	^{13 Val tRNA}
2552655	2552730	+	76	157159467	EcHS_A4684	-	^{10 Lys tRNA}
2678234	2678325	-	92	157159467	EcHS_A4757	-	sroE RNA
2691154	2691362	+	209	157159467	EcHS_A4758	-	IS128 RNA
2691494	2691797	+	304	157159467	EcHS_A4759	-	ryfA RNA
2729526	2729674	+	149	157159467	EcHS_A4760	-	tke1 RNA
2765684	2765799	-	116	157159467	EcHS_A4761	-	5S ribosomal RNA
2765894	2768797	-	2904	157159467	EcHS_A4762	-	23S ribosomal RNA
2768981	2769058	-	78	157159467	EcHS_A4686	-	^{04 Glu tRNA}
2769229	2770770	-	1542	157159467	EcHS_A4763	-	16S ribosomal RNA
2795869	2796231	+	363	157159467	EcHS_A4764	-	tmRNA
2803207	2803282	-	76	157159467	EcHS_A4687	-	^{16 Met tRNA}
2832351	2832425	+	75	157159467	EcHS_A4766	-	sraD RNA
2835200	2835278	-	79	157159467	EcHS_A4688	-	^{11 Arg tRNA}
2835475	2835553	-	79	157159467	EcHS_A4689	-	^{11 Arg tRNA}
2835614	2835692	-	79	157159467	EcHS_A4690	-	^{11 Arg tRNA}
2835889	2835967	-	79	157159467	EcHS_A4691	-	^{11 Arg tRNA}
2835969	2836063	-	95	157159467	EcHS_A4692	-	^{08 Ser tRNA}
2942365	2942724	-	360	157159467	EcHS_A4767	-	CsrB/RsmB RNA family
2960905	2961017	+	113	157159467	EcHS_A4768	-	gcvB RNA
2965596	2965672	+	77	157159467	EcHS_A4693	-	^{16 Met tRNA}
2965706	2965782	+	77	157159467	EcHS_A4694	-	^{16 Met tRNA}
2965816	2965892	+	77	157159467	EcHS_A4695	-	^{16 Met tRNA}
2965926	2966002	+	77	157159467	EcHS_A4696	-	^{16 Met tRNA}
2994422	2994509	-	88	157159467	EcHS_A4769	-	sraE/rygA/rygB family RNA
2994625	2994706	-	82	157159467	EcHS_A4770	-	sraE/rygA/rygB family RNA
3026497	3026572	-	76	157159467	EcHS_A4697	-	^{01 Gly tRNA}
3083494	3083676	+	183	157159467	EcHS_A4771	-	6S / SsrS RNA
3084326	3084476	+	151	157159467	EcHS_A4772	-	QUAD RNA
3139284	3139361	+	78	157159467	EcHS_A4698	-	^{17 Phe tRNA}
3158992	3159213	+	222	157159467	EcHS_A4773	-	C0719 RNA
3238140	3238289	-	150	157159467	EcHS_A4775	-	QUAD RNA
3238515	3238664	-	150	157159467	EcHS_A4776	-	QUAD RNA
3259042	3259119	+	78	157159467	EcHS_A4699	-	^{16 Met tRNA}
3281710	3281897	+	188	157159467	EcHS_A4777	-	SraF RNA
3318852	3319152	-	301	157159467	EcHS_A4778	-	RNase P, class A
3362151	3362324	+	174	157159467	EcHS_A4779	-	SraG RNA
3362554	3362668	-	115	157159467	EcHS_A4780	-	Ribosomal S15 leader
3369139	3369215	-	77	157159467	EcHS_A4700	-	^{16 Met tRNA}
3372997	3373085	-	89	157159467	EcHS_A4701	-	^{15 Leu tRNA}
3401504	3401611	+	108	157159467	EcHS_A4781	-	SraH RNA
3467768	3467883	-	116	157159467	EcHS_A4782	-	5S ribosomal RNA
3467922	3467999	-	78	157159467	EcHS_A4702	-	^{12 Thr tRNA}
3468013	3468128	-	116	157159467	EcHS_A4783	-	5S ribosomal RNA
3468223	3471126	-	2904	157159467	EcHS_A4784	-	23S ribosomal RNA
3471300	3471377	-	78	157159467	EcHS_A4703	-	^{02 Ala tRNA}
3471419	3471495	-	77	157159467	EcHS_A4704	-	^{14 Ile tRNA}
3471564	3473105	-	1542	157159467	EcHS_A4785	-	16S ribosomal RNA
3627962	3628051	-	90	157159467	EcHS_A4787	-	RyhB RNA
3706172	3706285	+	114	157159467	EcHS_A4788	-	IS183 RNA
3737918	3737996	-	79	157159467	EcHS_A4705	-	^{03 Pro tRNA}
3865805	3865899	+	95	157159467	EcHS_A4706	-	Sec tRNA
3970219	3971760	+	1542	157159467	EcHS_A4789	-	16S ribosomal RNA
3971845	3971922	+	78	157159467	EcHS_A4707	-	^{04 Glu tRNA}
3972115	3975018	+	2904	157159467	EcHS_A4790	-	23S ribosomal RNA
3975113	3975228	+	116	157159467	EcHS_A4791	-	5S ribosomal RNA
3975282	3975360	+	79	157159467	EcHS_A4708	-	^{06 Asp tRNA}
3975367	3975444	+	78	157159467	EcHS_A4709	-	^{20 Trp tRNA}
4010788	4010864	+	77	157159467	EcHS_A4710	-	^{11 Arg tRNA}
4010922	4010999	+	78	157159467	EcHS_A4711	-	^{09 His tRNA}
4011018	4011106	+	89	157159467	EcHS_A4712	-	^{15 Leu tRNA}
4011147	4011225	+	79	157159467	EcHS_A4713	-	^{03 Pro tRNA}
4013276	4013447	+	172	157159467	EcHS_A4792	-	SraJ RNA
4065789	4067330	+	1542	157159467	EcHS_A4793	-	16S ribosomal RNA
4067399	4067475	+	77	157159467	EcHS_A4714	-	^{14 Ile tRNA}
4067517	4067594	+	78	157159467	EcHS_A4715	-	^{02 Ala tRNA}
4067777	4070680	+	2904	157159467	EcHS_A4794	-	23S ribosomal RNA
4070869	4070984	+	116	157159467	EcHS_A4795	-	5S ribosomal RNA
4080070	4080188	+	119	157159467	EcHS_A4796	-	Spot 42 RNA
4081217	4081470	+	254	157159467	EcHS_A4797	-	CsrC RNA family
4187951	4188060	-	110	157159467	EcHS_A4798	-	oxyS RNA
4196325	4197867	+	1543	157159467	EcHS_A4800	-	16S ribosomal RNA
4197952	4198029	+	78	157159467	EcHS_A4716	-	^{04 Glu tRNA}
4198222	4201125	+	2904	157159467	EcHS_A4801	-	23S ribosomal RNA
4201221	4201336	+	116	157159467	EcHS_A4802	-	5S ribosomal RNA
4204969	4205046	+	78	157159467	EcHS_A4717	-	^{12 Thr tRNA}
4205054	4205138	+	85	157159467	EcHS_A4718	-	^{18 Tyr tRNA}
4205255	4205329	+	75	157159467	EcHS_A4719	-	^{01 Gly tRNA}
4205335	4205412	+	78	157159467	EcHS_A4720	-	^{12 Thr tRNA}
4219909	4220069	-	161	157159467	EcHS_A4803	-	sroH RNA
4237708	4239249	+	1542	157159467	EcHS_A4805	-	16S ribosomal RNA
4239334	4239411	+	78	157159467	EcHS_A4721	-	^{04 Glu tRNA}
4239604	4242507	+	2904	157159467	EcHS_A4806	-	23S ribosomal RNA
4242603	4242718	+	116	157159467	EcHS_A4807	-	5S ribosomal RNA
4386573	4386650	-	78	157159467	EcHS_A4722	-	^{17 Phe tRNA}
4417101	4417176	+	76	157159467	EcHS_A4723	-	^{01 Gly tRNA}
4417212	4417289	+	78	157159467	EcHS_A4724	-	^{01 Gly tRNA}
4417323	4417400	+	78	157159467	EcHS_A4725	-	^{01 Gly tRNA}
4532533	4532619	+	87	157159467	EcHS_A4726	-	^{15 Leu tRNA}
4609393	4609481	-	89	157159467	EcHS_A4727	-	^{15 Leu tRNA}
4609515	4609601	-	87	157159467	EcHS_A4728	-	^{15 Leu tRNA}
4609629	4609717	-	89	157159467	EcHS_A4729	-	^{15 Leu tRNA}