Трехмерные структуры РНК

Трехмерные структуры РНК

Используя программы молекулярного моделирования нужно построить трехмерные структуры изучаемых участков РНК.

• RNAInSpace - программное обеспечение молекулярного моделирования РНК, разрабатываемое в Викиверситете

Вироиды

• Третичные структуры вироидов

Рибозимы - "головка молотка"

• • hammerhead ribozyme (Synthetic construct) (ДНК последовательность)
    • Первичная последовательность: GCGCUCUGAUGAGGCCGCAAGGCCGAAACUGCCGCAAGGCAGUCAGCGC
  • Capturing hammerhead ribozyme structures in action by modulating general base catalysis
    • Hammerhead Ribozyme G12A mutant pre-cleavage
    • Hammerhead Ribozyme G12A mutant after cleavage
    • Первичная последовательность:
      • gggagcccugucaccggaugugcuuuccggucugaugaguccgugaggacaaaacagggcucccgaauu - до саморазрезания
      • gggagcccuguc—accggaugugcuuuccggucugaugaguccgugaggacaaaacagggcucccgaauu - после саморазрезания
    • Вторичная последовательность [1]

тРНК

• Третичные структуры транспортных РНК