FoldIt Wiki/Аминокислоты
Обзор
[править]Альфа-аминокислоты являются "строительными блоками" белков. Они образуются при реакции конденсации, в которой высвобождается вода и новый "аминокислотный остаток". Аминокислотные остатки удерживается вместе в составе белка благодаря пептидной связи. Белки определяются своей уникальной последовательностью аминокислотных остатков; эта последовательность является первичной структурой белка. Также, как буквы алфавита могут быть скомбинированы в почти бесконечное многообразие слов, аминокислоты могут быть объединены в различные последовательности, формируя огромное число белков.
Клетками при биосинтезе белков используются двадцать стандартных аминокислот, и их использование определяется общим генетическим кодом. Эти 20 аминокислот биологически синтезируются из других молекул, однако организмы различаются тем, какие из аминокислот они могут синтезировать сами и тем, какие из них должны присутствовать в питании. Аминокислоты, которые должны поступать с питанием, называют "незаменимыми".
Аминокислоты также являются основными единицами в игре Foldit. В структуре белка каждая аминокислота привносит в основную цепь одно звено и (обычно) одну боковую цепь у этого звена. Основная цепь определяет главные структурные особенности белка, а боковые цепи - особенности её биологической функции.
Ниже приведен список аминокислот, которые можно встретить в игре Foldit. Возможно, также использовались или будут использоваться некоторые другие, но перечисленные - самые распространённые.
| Аминокислота | 3х-буквенное сокращение | 1-буквенное сокращение | Полярность боковой цепи | Кислотность/основность боковой цепи у нейтральных видов | Гидрофобность | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| аланин | Ala | A | неполярная | нейтральная | 1,8 | |
| аргинин | Arg | R | полярная | основная (сильная) | -4,5 | |
| аспарагин | Asn | N | полярная | нейтральная | -3,5 | |
| аспарагиновая кислота | Asp | D | полярная | кислотная | -3,5 | |
| цистеин | Cys | C | полярная | нейтральная | 2,5 | |
| глутаминовая кислота | Glu | E | полярная | кислотная | -3,5 | |
| глутамин | Gln | Q | полярная | нейтральная | -3,5 | |
| глицин | Gly | G | неполярная | нейтральная | -0,4 | |
| гистидин | His | H | полярная | основная (слабая) | -3,2 | |
| изолейцин | Ile | I | неполярная | нейтральная | 4,5 | |
| лейцин | Leu | L | неполярная | нейтральная | 3,8 | |
| лизин | Lys | K | полярная | основная | -3,9 | |
| метионин | Met | M | неполярная | нейтральная | 1,9 | |
| фенилаланин | Phe | F | неполярная | нейтральная | 2,8 | |
| пролин | Pro | P | неполярная | нейтральная | -1,6 | |
| серин | Ser | S | полярная | нейтральная | -0,8 | |
| треонин | Thr | T | полярная | нейтральная | -0,7 | |
| триптофан | Trp | W | неполярная | нейтральная | -0,9 | |
| тирозин | Tyr | Y | полярная | нейтральная | -1,3 | |
| валин | Val | V | неполярная | нейтральная | 4,2 |